| MirGeneDB ID | Lan-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lingula (Lingula anatina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-67-v1 Aae-Mir-67-v2 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cgi-Mir-67-P4 Cgi-Mir-67-P5 Cgi-Mir-67-P6 Csc-Mir-67 Cte-Mir-67 Dan-Mir-67-v1 Dan-Mir-67-v2 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v1 Dme-Mir-67-v2 Dme-Mir-67-v3 Dmo-Mir-67-v1 Dmo-Mir-67-v2 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v1 Dsi-Mir-67-v2 Dsi-Mir-67-v3 Dya-Mir-67-v1 Dya-Mir-67-v2 Dya-Mir-67-v3 Efe-Mir-67-P1 Efe-Mir-67-P2 Efe-Mir-67-P3 Hme-Mir-67-v1 Hme-Mir-67-v2 Isc-Mir-67 Lgi-Mir-67 Lpo-Mir-67-P7 Lpo-Mir-67-P8 Lpo-Mir-67-P9 Lpo-Mir-67-P10 Lpo-Mir-67-P11 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ovu-Mir-67 Sme-Mir-67 Tca-Mir-67-v1 Tca-Mir-67-v2 Tca-Mir-67-v3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (LinAna_1.0) |
LFEI01001053: 100933-100993 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGUUUCCACGAGAUGUUUCUGCCACGUUUACCUCAAUCAGUGGGUUGUGAUGUAAUAGUGACGUCAUCACAACCUGCAUGAAGGAGGUAAAUUUGGCGGUUCUAUCAACAAAGUUUCCCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GAGUUUCCACGAGAUGUUU-- C AA -|UG UAAUA CUGCCA GUUUACCUC UCA G GGUUGUGAUG G GGCGGU UAAAUGGAG AGU C CCAACACUAC U ACCCUUUGAAACAACUAUCUU U GA A^GU UGCAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lan-Mir-67_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACCUCAAUCAGUGGGUUGUGAUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Lan-Mir-67_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UCACAACCUGCAUGAAGGAGGUAA -61
Get sequence
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