| MirGeneDB ID | Dmo-Mir-67-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila mojavensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dmo-mir-307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dmo-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-67-v2 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Csc-Mir-67 Cte-Mir-67 Dan-Mir-67-v2 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v2 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v2 Dya-Mir-67-v2 Hme-Mir-67-v2 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ovu-Mir-67 Sme-Mir-67 Tca-Mir-67-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dmoj_caf1) |
scaffold_6496: 24271692-24271757 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v2) |
Mir-67-v1
scaffold_6496: 24271692-24271757 [+]
Ensembl
Mir-67-v2 scaffold_6496: 24271692-24271757 [+] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAAGAAAACUAAGAAUUUUGUCUUGCUUUGACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUUAUUUCGAUUCGGUAUCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGAUAGCAGGAUAGAAUAUCCACAAAGCUAAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAAGAAAACUAAGAAUU-- -| A CCU G GUUAUUUCG UUGUCUUGCU UUG CUCACUCAA GG UGUGAU A GAUAGGACGA AGC GAGUGAGUU CC ACACUA U CAAAUCGAAACACCUAUAA U^ - CCU A CCUAUGGCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dmo-Mir-67-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dmo-Mir-67-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0008665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- CACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -66
Get sequence
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