| MirGeneDB ID | Dme-Bantam | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | BANTAM (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGAUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-bantam | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Bantam Asu-Bantam-o1 Asu-Bantam-o2 Asu-Bantam-o3 Bge-Bantam Bpl-Bantam Cbr-Bantam-P1a Cbr-Bantam-P1b Cbr-Bantam-P2 Cbr-Bantam-P3 Cbr-Bantam-P4 Cel-Bantam-P1 Cel-Bantam-P2 Cel-Bantam-P3 Cel-Bantam-P4 Cel-Bantam-P5a Cel-Bantam-P5b Cel-Bantam-P5c Cgi-Bantam Csc-Bantam-P16 Csc-Bantam-P17 Cte-Bantam Dan-Bantam Dma-Bantam Dmo-Bantam Dpu-Bantam Dsi-Bantam Dya-Bantam Efe-Bantam-P6 Efe-Bantam-P7 Efe-Bantam-P8 Esc-Bantam Hme-Bantam Isc-Bantam-P9a Isc-Bantam-P9b Lan-Bantam Lgi-Bantam Lpo-Bantam-P10 Lpo-Bantam-P11 Lpo-Bantam-P12 Lpo-Bantam-P13 Lpo-Bantam-P14 Lpo-Bantam-P15 Npo-Bantam Ovu-Bantam Sme-Bantam-P18 Sme-Bantam-P19 Sme-Bantam-P20 Tca-Bantam | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3L: 642222-642281 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GUUUGUAACUCCAAUGAUUUGACUACGAAACCGGUUUUCGAUUUGGUUUGACUGUUUUUCAUACAAGUGAGAUCAUUUUGAAAGCUGAUUUUGUCAAUGAAUACCACAUUCCACAUUCCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GUUUGUAACUCCAAUGAU-----| UAC C UU G GUUUU UUGAC GAAA CGGUUUUCGA UGGUUU ACU U AACUG UUUU GUCGAAAGUU ACUAGA UGA C GCCUUACACCUUACACCAUAAGU^ --- A UU G ACAUA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Bantam_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCGGUUUUCGAUUUGGUUUGACU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Bantam_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000365 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UGAGAUCAUUUUGAAAGCUGAUU -60
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000365 TargetScanFly: dme-bantam |
