| MirGeneDB ID | Dme-Mir-29-P2h | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-29 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGCACCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-998 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dme-Mir-29-P1 Dme-Mir-29-P2g | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-29-P2h Asu-Mir-29-P2 Bfl-Mir-29-P2 Bge-Mir-29-P2h Bla-Mir-29-P2 Cbr-Mir-29-P2 Cel-Mir-29-P2 Cgi-Mir-29-P2 Cin-Mir-29-P2 Csc-Mir-29-P2 Cte-Mir-29-P2 Dan-Mir-29-P2h Dma-Mir-29-P2h Dmo-Mir-29-P2h Dpu-Mir-29-P2h Dsi-Mir-29-P2h Dya-Mir-29-P2h Esc-Mir-29-P2 Hme-Mir-29-P2h Isc-Mir-29-P2 Lgi-Mir-29-P2 Npo-Mir-29-P2 Obi-Mir-29-P2 Ovu-Mir-29-P2 Pfl-Mir-29-P2 Pmi-Mir-29-P2 Sko-Mir-29-P2 Spu-Mir-29-P2 Tca-Mir-29-P2h Xbo-Mir-29-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3R: 21621902-21621998 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-29-P2h) |
Mir-29-P2h
3R: 21621902-21621998 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-2-P7 3R: 21622503-21622563 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAAUCGUCCUCGUGUCAAAUUCAUUUUGGAACUGAAUUCUCGUGGGUCUGCACUGACAACACUGACCGCUCCAGGGCAAAUUGUUCAUUUUGAAAUUGAAAUUCUGUAGCACCAUGAGAUUCAGCUCUGGCGUGAAUUUCAAACAUGCAUCCACAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 CAAUCGUCCUCGUGUCA--| U UG A U GU CUGACAACACUGACCGCUCCAGGGC AAUUCAU U GA CUGAAU CUCGUGG CUGCA A UUAAGUG G CU GACUUA GAGUACC GAUGU A CAACACCUACGUACAAACU^ C GU C - AC CUUAAAGUUAAAGUUUUACUUGUUA 150 140 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-29-P2h_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUGAAUUCUCGUGGGUCUGCA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-29-P2h_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005518 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
76- UAGCACCAUGAGAUUCAGCUC -97
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005518 TargetScanFly: dme-miR-998 |
