| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-592 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGUGUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-592 Cfa-Mir-592 Cpo-Mir-592 Dno-Mir-592 Ete-Mir-592 Hsa-Mir-592 Mml-Mir-592 Ocu-Mir-592 Rno-Mir-592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr6: 27936672-27936732 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAAUUAAUUCCAUGAUAUUAUGCCAUGACAUUGUGUCAAUAUGCGAUGAUGUGUUGUGAUGGCACAGCGUCAUCACGUGGUGACGCAACAUCAUGACGUAAGACAUCACAUCGCCAAUUAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UAAUUAAUUCCAUGAUA---| C CA A C GUUGUG UUAUG CAUGA UUGUGUCA UAUG GAUGAUGU A AAUGC GUACU AACGCAGU GUGC CUACUGCG U AAUUAACCGCUACACUACAG^ A AC G A ACACGG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | Mir-592 was classified in Fromm et al. (2015) as a non-canonical miRNA as the Dicer cut is always +3 but given the conservation of the sequence and that it is clearly processed by Drosha it is accepted here as a bona fide miRNA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-592_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0003730 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUGUGUCAAUAUGCGAUGAUGU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003730 TargetScanVert: mmu-miR-592-5p miRDB: MIMAT0003730 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-592_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017234 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UCAUCACGUGGUGACGCAACAU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-592-3p miRDB: MIMAT0017234 |
