| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-224 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-224 Cfa-Mir-224 Cpo-Mir-224 Ete-Mir-224 Hsa-Mir-224 Mml-Mir-224 Ocu-Mir-224 Rno-Mir-224 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chrX: 72261036-72261105 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-224) |
Mir-224
chrX: 72261036-72261105 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-452-v1 chrX: 72262235-72262295 [-] UCSC Ensembl Mir-452-v2 chrX: 72262236-72262292 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUGGCAGAAGAGACAAGGCCCGGGGGCUUUUAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUAGUAGAUGGUUUGUGCAUUGUUUCAAAAUGGUGCCCUAGUGACUACAAAGCCCCAGAGCCAGCAUCAUCGGUGAAGCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUGGCAGAAGAGACAAG--| CCG UA U U AGUAGAUGGUUU GC GGGGCUUU AGUCACUAG GGU CCGUUU \ CG CCCCGAAA UCAGUGAUC CCG GGUAAA G ACGAAGUGGCUACUACGAC^ AGA CA - U ACUUUGUUACGU . 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-224_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUAG -24
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000671 TargetScanVert: mmu-miR-224-5p miRDB: MIMAT0000671 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-224_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017062 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
47- AAAUGGUGCCCUAGUGACUACAA -70
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-224-3p miRDB: MIMAT0017062 |






