| MirGeneDB ID | Mml-Mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-433 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAUGAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-433 Cfa-Mir-433 Cpo-Mir-433 Dno-Mir-433 Ete-Mir-433 Hsa-Mir-433 Mmu-Mir-433 Ocu-Mir-433 Rno-Mir-433 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (rheMac8_trace) |
chr7: 163216095-163216168 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-433) |
Mir-770
chr7: 163185011-163185072 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 chr7: 163202852-163202913 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v1 chr7: 163207997-163208056 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 chr7: 163207997-163208056 [+] UCSC Ensembl Mir-431 chr7: 163215224-163215287 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chr7: 163216095-163216168 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chr7: 163217199-163217254 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chr7: 163218697-163218765 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chr7: 163218917-163218972 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chr7: 163218917-163218972 [+] UCSC Ensembl Mir-370 chr7: 163245322-163245378 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAAGAAGAAGACCCAAUGCCCAGGGAGAAGUACGGUGAGCCUGUCAUUAUUCAGAGAGGCUAGAUCCUCUGUGUUGAGAAGGAUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGUUCUCCAGGUAGCGGCACCACACCAUGAAGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAGAAGAAGACCCAAU- --| AG GUA U U AGAGAGGCUAGAU GC CC GGAGAA CGG GAGCCUGUCAU AUUC C CG GG CCUCUU GCU CUCGGGUAGUA UAGG C GGAAGUACCACACCACGG AU^ A- GUG C C AAGAGUUGUGUCU 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-433_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0026875 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACGGUGAGCCUGUCAUUAUUC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-433-5p |
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| Mature sequence | Mml-Mir-433_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
52- AUCAUGAUGGGCUCCUCGGUGU -74
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-433-3p |
