| MirGeneDB ID | Hme-Mir-2001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2001 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUGUGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bge-Mir-2001-P1 Bge-Mir-2001-P2 Cbr-Mir-2001 Cel-Mir-2001 Cgi-Mir-2001 Csc-Mir-2001 Cte-Mir-2001 Dan-Mir-2001 Dme-Mir-2001 Dmo-Mir-2001 Dsi-Mir-2001 Dya-Mir-2001 Isc-Mir-2001 Lan-Mir-2001-P3 Lan-Mir-2001-P4 Lgi-Mir-2001 Lpo-Mir-2001 Npo-Mir-2001 Pfl-Mir-2001 Pmi-Mir-2001 Sko-Mir-2001 Spu-Mir-2001 Xbo-Mir-2001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Hmel_1) |
HE669201: 27587-27644 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2001) |
Mir-252-P2
HE669201: 11729-11788 [-]
Ensembl
Mir-252-P1 HE669201: 24262-24317 [-] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAACAAAGAAGAAUUUGUUAGCGAAGUUGGUUUGUGACCGUCACUAACGGGCAGUUGUGUGUUUGCUCGUUUUGACGAUCGCAAAAUGAACUCGCUUGACGUUAAUACAUCAUUUUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AAACAAAGAAGAAUUUGUU---| A G - C CU GUUG AGCGA GUU GUUU GUGA CGUCA AACGGGCA U UCGCU CAA UAAA CGCU GCAGU UUGCUCGU G GUUUUUACUACAUAAUUGCAGU^ - G A A U- UUGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Hme-Mir-2001_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUUGUGACCGUCACUAACGGGCA -23
Get sequence
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| Star sequence | Hme-Mir-2001_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CUCGUUUUGACGAUCGCAAAAUG -58
Get sequence
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