| MirGeneDB ID | Gmo-Mir-219-P3a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-219 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAUUGUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Cod (Gadus morhua) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | gmo-mir-219-3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Gmo-Mir-219-P2a Gmo-Mir-219-P3b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-219 Aca-Mir-219-P3 Ami-Mir-219-P3 Bfl-Mir-219 Bge-Mir-219 Bla-Mir-219 Bta-Mir-219-P3 Cfa-Mir-219-P3 Cgi-Mir-219 Cin-Mir-219 Cmi-Mir-219-P3 Cpi-Mir-219-P3 Cpo-Mir-219-P3 Csc-Mir-219 Cte-Mir-219 Dan-Mir-219 Dma-Mir-219 Dme-Mir-219 Dmo-Mir-219 Dno-Mir-219-P3 Dpu-Mir-219 Dre-Mir-219-P3a Dsi-Mir-219 Dya-Mir-219 Esc-Mir-219 Ete-Mir-219-P3 Gja-Mir-219-P3 Hsa-Mir-219-P3 Isc-Mir-219 Lan-Mir-219 Lch-Mir-219-P3 Mal-Mir-219-P3a Mdo-Mir-219-P3 Mml-Mir-219-P3 Mmu-Mir-219-P3 Mmu-Mir-219-P3-as Mun-Mir-219-P3-v1 Mun-Mir-219-P3-v2 Obi-Mir-219 Ocu-Mir-219-P3 Ovu-Mir-219 Pbv-Mir-219-P3 Pfl-Mir-219 Pmi-Mir-219 Rno-Mir-219-P3 Sha-Mir-219-P3 Sko-Mir-219 Spt-Mir-219-P3 Spu-Mir-219 Sto-Mir-219-P3-v1 Sto-Mir-219-P3-v2 Tca-Mir-219 Tni-Mir-219-P3a Xbo-Mir-219 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Gadus_morhua.gadMor1.dna.toplevel) |
GeneScaffold_752: 202020-202079 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCACAUGGGUGGAACUCAGAGUCUAGGGUUGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUGUAUCUCUGAAACCAGGAGUUGUGCAUGGACAUCUAACACUCGGCUGCUGCUAAACAGAUCCAGAUGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CUCACAUGGGUGGAACU- -| U G AU AA UAUCU CAG AGUC AG GUUG UGUCCA CGCAAUUCUUG C GUC UCGG UC CAAU ACAGGU GUGUUGAGGAC U AGUAGACCUAGACAAAUC G^ C A CU AC CAAAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Gmo-Mir-219-P3a_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAUUGUCCAAACGCAAUUCUUG -23
Get sequence
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| Star sequence | Gmo-Mir-219-P3a_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0044313 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GGAGUUGUGCAUGGACAUCUAAC -60
Get sequence
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