| MirGeneDB ID | Sha-Mir-7373-o3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7373 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGGCACU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Sha-Mir-7373-o1 Sha-Mir-7373-o2 Sha-Mir-7373-o4 Sha-Mir-7373-o5 Sha-Mir-7373-o6 Sha-Mir-7373-o7 Sha-Mir-7373-o8a Sha-Mir-7373-o8b Sha-Mir-7373-o8c Sha-Mir-7373-o8d1 Sha-Mir-7373-o8d2 Sha-Mir-7373-o8e Sha-Mir-7373-o8f Sha-Mir-7373-o8g Sha-Mir-7373-o8h Sha-Mir-7373-o8i Sha-Mir-7373-o8j Sha-Mir-7373-o9a Sha-Mir-7373-o9b Sha-Mir-7373-o9c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Mdo-Mir-7373-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | S. harrisii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (DEVIL_add) |
GL867601.1: 2091074-2091128 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAGAGGACGGACACUGAGAGAUGGUGAGACAAGCCCUUUUAUUAGUGAUUGGGAUAUUUUCCUCAGGCACUAAGAAAGGGUUUCUUUCUUCAUCUCAAAACGCAAAGCCAUUCAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AAGAGGACGGACACUGA--| U C A A AUA GAGAUGG GAGA AAGCCCUUUU UUAGUG UUGGG U CUCUACU CUUU UUUGGGAAAG AAUCAC GACUC U UACUUACCGAAACGCAAAA^ U C - G CUU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Sha-Mir-7373-o3_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGCCCUUUUAUUAGUGAUUGGG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Sha-Mir-7373-o3_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- CAGGCACUAAGAAAGGGUUUCU -55
Get sequence
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