| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-483 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGACGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-483-v1 Bta-Mir-483-v2 Cfa-Mir-483 Cpo-Mir-483 Dno-Mir-483 Ete-Mir-483 Hsa-Mir-483 Mml-Mir-483 Ocu-Mir-483 Rno-Mir-483 Sha-Mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 142654930-142654989 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCCAACCUCGGACCGUGGGGGAGAGGGGGAAGACGGGAGAAGAGAAGGGAGUGGUUUUUGGGUGCCUCACUCCUCCCCUCCCGUCUUGUUCUCUCCUGCCCUAUCUUCCCUUCCUGUCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GCCCAACCUCGGACCGU- --| G A AA A G UGGUUU GGG GGAGAGGG GA GACGGGAG GAG AG GAG U CCC CCUCUCUU UU CUGCCCUC CUC UC CUC U ACUGUCCUUCCCUUCUAU GU^ G - CC C A CGUGGG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-483_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0004782 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGACGGGAGAAGAGAAGGGAG -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004782 TargetScanVert: mmu-miR-483-5p miRDB: MIMAT0004782 |
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| Co-mature sequence | Mmu-Mir-483_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0003120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CACUCCUCCCCUCCCGUCUUGU -60
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003120 TargetScanVert: mmu-miR-483-3p.2 miRDB: MIMAT0003120 |
