| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-483 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGACGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-483-v1 Bta-Mir-483-v2 Cpo-Mir-483 Dno-Mir-483 Ete-Mir-483 Hsa-Mir-483 Mml-Mir-483 Mmu-Mir-483 Ocu-Mir-483 Rno-Mir-483 Sha-Mir-483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Theria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr18: 46298398-46298459 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCUUGGAGCCUGAGCAGCGGAGGGACGGGGAGGACGGGAGGAAAGGAGGACGUGGUUUCAUGCAGGUCCUCACUCCUCCCCUCCCGUCUUCCUCUUCCUCUCCCAAGCCUGCCUCAGCGUGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CCUUGGAGCCUGAGCAGC- -| C AAA C UUUCAU GGAG GGA GGGGAGGACGGGAGG GGAGGA GUGG G CCUC CCU CUCCUUCUGCCCUCC CCUCCU CACU C GGUGCGACUCCGUCCGAAC U^ U --- - CCUGGA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-483_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGACGGGAGGAAAGGAGGACGUGGU -26
Get sequence
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| Co-mature sequence | Cfa-Mir-483_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0009901 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UCACUCCUCCCCUCCCGUCUUCC -62
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-483 miRDB: MIMAT0009901 |
