| MirGeneDB ID | Mml-Mir-605-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-605 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mml-mir-605 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mml-Mir-605-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-605-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Catarrhini | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (rheMac8_trace) |
chr9: 81534767-81534825 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-605-v2) |
Mir-605-v2
chr9: 81534767-81534825 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-605-v1 chr9: 81534768-81534824 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUAACAUAUGUCUGUAACCCUAGCUUGGUUCUAAAUCCCACGGUGCCUUCUCCUUGGGAAAAACAGAGAAGGCACUGUGGGAUUUAGAACCAAGUUAGGACUAAAGAUUCAGAUUACCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50
AUAACAUAUGUCUGUAAC--| CUUGGG
CCUAGCUUGGUUCUAAAUCCCACGGUGCCUUCUC \
GGAUUGAACCAAGAUUUAGGGUGUCACGGAAGAG A
UCCAUUAGACUUAGAAAUCA^ ACAAAA
110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mml-Mir-605-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0006460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUAAAUCCCACGGUGCCUUCUC -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-605 |
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| Mature sequence | Mml-Mir-605-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GAAGGCACUGUGGGAUUUAGAA -59
Get sequence
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