| MirGeneDB ID | Lan-Mir-1992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1992 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGCAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lingula (Lingula anatina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cgi-Mir-1992 Cte-Mir-1992 Efe-Mir-1992-P3 Efe-Mir-1992-P4 Esc-Mir-1992 Lgi-Mir-1992-P1 Lgi-Mir-1992-P2 Npo-Mir-1992 Obi-Mir-1992 Ovu-Mir-1992 Sme-Mir-1992-P5 Sme-Mir-1992-P6-v1 Sme-Mir-1992-P6-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Platytrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Platytrochozoa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (LinAna_1.0) |
LFEI01000407: 220692-220752 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGAAGAAGAUGAAGAAAGCUGGCACCAGAUCGUCAGUGUUCAAUUGUUGAUAUGUGCCUGAACUUAUAUCAGCAGUUGUACCACUGAUGUUUUGUUACUAGCCUACCAAACUCAAGGAAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGAAGAAGAUGAAGAAA-- CAC U UU-| UGUGCC GCUGG CAGA CGUCAGUG CAAUUGUUGAUA U CGAUC GUUU GUAGUCAC GUUGACGACUAU G CAAAGGAACUCAAACCAUC AUU U CAU^ AUUCAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lan-Mir-1992_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGUCAGUGUUCAAUUGUUGAUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Lan-Mir-1992_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UCAGCAGUUGUACCACUGAUGUU -61
Get sequence
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