| MirGeneDB ID | Hsa-Mir-1911 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1911 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGUACC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Human (Homo sapiens) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hsa-mir-1911 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1911 Cfa-Mir-1911 Mml-Mir-1911 Ocu-Mir-1911 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (hg38) |
chrX: 114763195-114763253 [+] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1911) |
Mir-1298
chrX: 114715250-114715325 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1911 chrX: 114763195-114763253 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGUAUCCAUCAUCAUUUGCUCGGCAUCUGCUGAGUACCGCCAUGUCUGUUGGGCAUCCACAGUCUCCCACCAGGCAUUGUGGUCUCCGCUGACGCUUUGCCAUUUCGCCACCGGUGCCUGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GGUAUCCAUCAUCAUUU--| UC A U U U C U CAUCC GC GGC UC GC GAG ACCGC AUGUCUG UGGG A CG UCG AG CG CUC UGGUG UACGGAC ACCC C UCCGUGGCCACCGCUUUAC^ UU C U C - U C UCUGA 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Hsa-Mir-1911_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0007885 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGUACCGCCAUGUCUGUUGGG -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0007885 TargetScanVert: hsa-miR-1911-5p TargetMiner: hsa-miR-1911-5p miRDB: MIMAT0007885 |
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| Star sequence | Hsa-Mir-1911_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0007886 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CACCAGGCAUUGUGGUCUCCGC -59
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0007886 TargetScanVert: hsa-miR-1911-3p TargetMiner: hsa-miR-1911-3p miRDB: MIMAT0007886 |






