| MirGeneDB ID | Hme-Mir-306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-306 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGGUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hme-mir-306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-306 Bge-Mir-306 Dan-Mir-306 Dme-Mir-306 Dmo-Mir-306 Dsi-Mir-306 Dya-Mir-306 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Hmel_1) |
HE669612: 9837-9892 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-306) |
Mir-9-o3
HE669612: 9693-9752 [-]
Ensembl
Mir-306 HE669612: 9837-9892 [-] Ensembl Mir-9-o1 HE669612: 10319-10377 [-] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGACGGGGUGGGGCGGCCGCGCGCGUCGUGUCAGGUACUAGGUGACUCUGAGUGGAAUGGUCUCAGAGACGCCUCGUGCCUCAGCACGGCGGCGCGGCCGCGGCGAUGACGAGACAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGACGGGGUGGGGCGGC---| G C- U A UGGA CGCGC CGUCGUGU AGGUAC AGGUG CUCUGAG \ GCGCG GCGGCACG UCCGUG UCCGC GAGACUC A ACAGAGCAGUAGCGGCGCCG^ - AC C A UGGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Hme-Mir-306_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0024975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAGGUACUAGGUGACUCUGAG -22
Get sequence
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| Star sequence | Hme-Mir-306_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
33- CAGAGACGCCUCGUGCCUCAGCA -56
Get sequence
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