| MirGeneDB ID | Hme-Mir-2763-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2763 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAUUAUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hme-mir-2763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Hme-Mir-2763-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | H. melpomene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | H. melpomene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Hmel_1) |
HE672065: 139460-139521 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2763-v2) |
Mir-2763-v1
HE672065: 139460-139521 [-]
Ensembl
Mir-2763-v2 HE672065: 139460-139521 [-] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UACGUAUAAUUAAUUAAUCUACAACGUCACCCAAAGUAGUGAACGUAAUUUAUCGUGAGCUAUCUAUAGAUAUUAUGCUCAUUACUUUGGAGAAGUUGUACGAACAUUCAUCGAUGGAGAAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UACGUAUAAUUAAUUAA-- -| G AC A UU GUGAGC UC UACAAC UC CCAAAGUAGUGA CGUAA UAUC U AG AUGUUG AG GGUUUCAUUACU GUAUU AUAG A UAAGAGGUAGCUACUUACA C^ A A- C -- AUAUCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hme-Mir-2763-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAAAGUAGUGAACGUAAUUUAUCG -25
Get sequence
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| Mature sequence | Hme-Mir-2763-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0024955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AUAUUAUGCUCAUUACUUUGGAG -62
Get sequence
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