| MirGeneDB ID | Dno-Mir-337-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-337 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCUAUAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dno-Mir-337-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cpo-Mir-337-v1 Hsa-Mir-337-v1 Mml-Mir-337-v1 Mmu-Mir-337 Ocu-Mir-337-v1 Rno-Mir-337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH568228: 2142-2201 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-337-v1) |
Mir-337-v1
JH568228: 2142-2201 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-337-v2 JH568228: 2142-2201 [-] UCSC Ensembl Mir-493 JH568228: 5543-5604 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGCCGCGGCCCGGCAGUAGGUGGGGGGUGGGAACGGCUUCAUACAGGAGUUGGUGGACAGUUAUCCAGCUCCUAUAUGAUGCCUUUCUUCAUCCCCUUCGACCGCGCGCAGCAGCCCCGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GGCCGCGGCCCGGCAGUA---| U - C U C UGGUGGAC GG GGGGGGUGG GAA GGC UCAUA AGGAGU \ CU UCCCCUACU CUU CCG AGUAU UCCUCG A GGCCCCGACGACGCGCGCCAG^ - U U U A ACCUAUUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-337-v1_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0047817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAACGGCUUCAUACAGGAGU -20
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-337-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047818 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UCCUAUAUGAUGCCUUUCUUC -60
Get sequence
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