| MirGeneDB ID | Cte-Mir-2686-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2686 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGAUGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Polychaete worm (Capitella teleta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cte-mir-2686c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cte-Mir-2686-P2 Cte-Mir-2686-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Efe-Mir-2686-o1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. teleta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Annelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Capitella_teleta_v1.0) |
CAPTEscaffold_174: 220483-220549 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2686-P1) |
Mir-2686-P1
CAPTEscaffold_174: 220483-220549 [+]
Ensembl
Mir-2686-P2 CAPTEscaffold_174: 220637-220693 [+] Ensembl Mir-2686-P3 CAPTEscaffold_174: 220806-220865 [+] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCAUGAGCCCUCGCGGUCAUAUCACAAGAACCUAUAUUUGGGACAGCUCUCAUGGAACUCUUGAUAUCAUAGAAAGAUGUUCUUAAUGUAGGUUUCUUGUGCUGACCUUUAUCAACGAACUGACCCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UUCAUGAGCCCUCGCGG----| UAU - U G C AUGGAACUC UCA CACAAGAA CCUAUAUU GGGACA CU UC U AGU GUGUUCUU GGAUGUAA UCUUGU GA AG U CCCAGUCAAGCAACUAUUUCC^ C-- U U A A AUACUAUAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cte-Mir-2686-P1_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACCUAUAUUUGGGACAGCUCUC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cte-Mir-2686-P1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0013538 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- AAGAUGUUCUUAAUGUAGGUUUC -67
Get sequence
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