| MirGeneDB ID | Cpo-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-374 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAUAAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cpo-mir-374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-374-P1 Cfa-Mir-374-P1 Dno-Mir-374-P1 Hsa-Mir-374-P1 Mml-Mir-374-P1 Ocu-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (cavPor3) |
scaffold_26: 22992971-22993022 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-374-P1) |
Mir-374-P1
scaffold_26: 22992971-22993022 [+]
UCSC
Mir-95-P3 scaffold_26: 22993124-22993186 [+] UCSC |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCCUUUGGAAAGAUAUUUUACAUAGGCCUUUAUAAUACAACCUGAUAAGUGUUAUAACACUUACCAGAUUGUAUUGUAAUUGUCUGUGUAUAUAUCUGUCUAUCUUCCUAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 ACCCUUUGGAAAGAUAUUU--| CU C A UU UACAUAGGC UUAUAAUACAA CUG UAAGUG A AUGUGUCUG AAUGUUAUGUU GAC AUUCAC U UAUCCUUCUAUCUGUCUAUAU^ UU A C AA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cpo-Mir-374-P1_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0047205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Cpo-Mir-374-P1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047206 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
30- CUUACCAGAUUGUAUUGUAAUU -52
Get sequence
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