| MirGeneDB ID | Cmi-Mir-153-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-153 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGCAUAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Australian ghostshark (Callorhinchus milii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cmi-Mir-153-P2 Cmi-Mir-153-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-153-P1 Ami-Mir-153-P1 Asu-Mir-153 Bfl-Mir-153 Bla-Mir-153 Bpl-Mir-153 Bta-Mir-153-P1 Cfa-Mir-153-P1 Cgi-Mir-153 Cin-Mir-153 Cli-Mir-153-P1 Cpi-Mir-153-P1 Cpo-Mir-153-P1 Cte-Mir-153 Dma-Mir-153 Dno-Mir-153-P1 Dpu-Mir-153 Dre-Mir-153-P1a Ete-Mir-153-P1 Gga-Mir-153-P1 Gja-Mir-153-P1 Gmo-Mir-153-P1a Gmo-Mir-153-P1b Hsa-Mir-153-P1 Isc-Mir-153 Lan-Mir-153 Lch-Mir-153-P1 Lgi-Mir-153 Loc-Mir-153-P1 Mal-Mir-153-P1a Mal-Mir-153-P1b Mdo-Mir-153-P1 Mml-Mir-153-P1 Mmu-Mir-153-P1 Mun-Mir-153-P1 Npo-Mir-153 Oan-Mir-153-P1 Obi-Mir-153 Ocu-Mir-153-P1 Ovu-Mir-153 Pbv-Mir-153-P1 Pfl-Mir-153 Pma-Mir-153-o1 Pmi-Mir-153 Rno-Mir-153-P1 Sha-Mir-153-P1 Sko-Mir-153 Sme-Mir-153 Spt-Mir-153-P1 Spu-Mir-153 Sto-Mir-153-P1 Tgu-Mir-153-P1 Tni-Mir-153-P1b Xbo-Mir-153 Xla-Mir-153-P1c Xla-Mir-153-P1d Xtr-Mir-153-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165045.2_Callorhinchus_milii-6.1.3) |
KI636064.1: 217179-217238 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGUUGCCAGCUAAACUAACAGUUGCCAGUGUCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCUAGUAAUAUGAUCUCAGUUGCAUAGUCACAAAAGUGAUUAUUGGAAACUGUGUCUGCAGCAGGGACAGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGUUGCCAGCUAAACUA- G -| GU AGUAAU ACAGUU CCAGU GUCAUUUUUGUGAU UGCAGCU A UGUCAA GGUUA UAGUGAAAACACUG ACGUUGA U AGACAGGGACGACGUCUG A U^ AU CUCUAG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cmi-Mir-153-P1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAUUUUUGUGAUGUUGCAGCU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cmi-Mir-153-P1_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- UUGCAUAGUCACAAAAGUGAUU -60
Get sequence
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