| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-95-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAACAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cfa-Mir-95-P1 Cfa-Mir-95-P3-v1 Cfa-Mir-95-P3-v2 Cfa-Mir-95-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-95-P2 Dno-Mir-95-P2 Hsa-Mir-95-P2 Mml-Mir-95-P2 Mmu-Mir-95-P2 Ocu-Mir-95-P2 Rno-Mir-95-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chrX: 57550054-57550110 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-95-P2) |
Mir-95-P2
chrX: 57550054-57550110 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-374-P2 chrX: 57550217-57550268 [-] UCSC Ensembl Mir-95-P3-v1 chrX: 57590222-57590284 [-] UCSC Ensembl Mir-95-P3-v2 chrX: 57590223-57590282 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 chrX: 57590394-57590445 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCGGUGCCUAAUCCCGUGCACAUUGUAGGCCUCAUUAAAUGUUUGUUGAAUGAAAAAAUGAAUCAUCAACAGACAUUAAUUGGGCGCCUGCUCUGUGAUCUCCAUGGGCUCAGCUUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UCGGUGCCUAAUCCCGUG-- UU -| UUA A AAAA CACA GUAGGC CUCA AAUGUUUGUUGA UGA \ GUGU CGUCCG GGGU UUACAGACAACU ACU A UUUCGACUCGGGUACCUCUA CU C^ UAA - AAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cfa-Mir-95-P2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUCAUUAAAUGUUUGUUGAAUGA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Cfa-Mir-95-P2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- AUCAACAGACAUUAAUUGGGCGC -57
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-421 miRDB: MIMAT0006755 |






