| MirGeneDB ID | Bta-Mir-582-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-582 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AACCAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | bta-mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Bta-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cfa-Mir-582-v2 Cpo-Mir-582-v2 Dno-Mir-582-v2 Hsa-Mir-582-v2 Mml-Mir-582-v2 Mmu-Mir-582-v2 Ocu-Mir-582 Rno-Mir-582-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037347.1: 19584398-19584455 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-582-v2) |
Mir-582-v1
NC_037347.1: 19584397-19584456 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-582-v2 NC_037347.1: 19584398-19584455 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCUCAACACUUCAAUCUGUUCUCUUUGGUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUACCUAAUUGUAACCAGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUGAAAACAUUUCUUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 ACCUCAACACUUCAAUC--| U UUA CA UAAUCU UGU CUCUUUGG CAGUUGUUCAAC GUUAC A ACG GGGAAACC GUCAACAAGUUG CAAUG C GUUUCUUUACAAAAGUGAA^ U CAA AC UUAAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Bta-Mir-582-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0009351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UACAGUUGUUCAACCAGUUACU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: bta-miR-582 |
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| Mature sequence | Bta-Mir-582-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UAACCAGUUGAACAACUGAACC -58
Get sequence
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