| MirGeneDB ID | Aca-Mir-727-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-727 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUGAGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Green anole lizard (Anolis carolinensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | aca-mir-727 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Aca-Mir-727-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cpi-Mir-727-v2 Spt-Mir-727 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Osteichthyes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (anoCar2) |
3: 28511687-28511748 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-727-v2) |
Mir-727-v1
3: 28511685-28511750 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-727-v2 3: 28511687-28511748 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGGAACUUGAUUGCCCUGUAUGUCAUUUUCAGUCUUCAAUUCCUCCCAGCCCGUUAAAUGGAAAAGGUGAGUUGAGGCGAGUUGAAGACUAAAAAUGCUGUGCAGAUUCAAGGUAACUUUCCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGGAACUUGAUUGCCCU--| U C CU - CCGUUAAAU GUAUG CAUUUU AGUCUUCAAUUC CC CAGC G CGUGU GUAAAA UCAGAAGUUGAG GG GUUG G CCUUUCAAUGGAACUUAGA^ C A C- A AGUGGAAAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Aca-Mir-727-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0021987 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUCUUCAAUUCCUCCCAGCCC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Aca-Mir-727-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0021988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- GUUGAGGCGAGUUGAAGACUAA -62
Get sequence
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