| MirGeneDB ID | Aae-Mir-210-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-210 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUGUGCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | aae-mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Aae-Mir-210-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-210 Ami-Mir-210 Bfl-Mir-210 Bge-Mir-210-v2 Bla-Mir-210 Bta-Mir-210 Cfa-Mir-210 Cgi-Mir-210 Cli-Mir-210 Cmi-Mir-210 Cpi-Mir-210 Cpo-Mir-210 Dan-Mir-210-v2 Dma-Mir-210 Dme-Mir-210-v2 Dmo-Mir-210-v2 Dno-Mir-210 Dpu-Mir-210 Dre-Mir-210 Dsi-Mir-210-v2 Dya-Mir-210-v2 Ebu-Mir-210 Efe-Mir-210 Ete-Mir-210 Gga-Mir-210 Gja-Mir-210 Gmo-Mir-210 Hsa-Mir-210 Isc-Mir-210 Lan-Mir-210 Lch-Mir-210 Lgi-Mir-210 Loc-Mir-210 Mal-Mir-210 Mdo-Mir-210 Mml-Mir-210 Mmu-Mir-210 Mun-Mir-210 Npo-Mir-210 Oan-Mir-210 Ocu-Mir-210 Pbv-Mir-210 Pma-Mir-210 Pmi-Mir-210-v2 Rno-Mir-210 Sha-Mir-210 Sko-Mir-210 Spt-Mir-210 Spu-Mir-210-v2 Tca-Mir-210-v2 Tgu-Mir-210 Tni-Mir-210 Xtr-Mir-210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.512: 515646-515703 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-210-v2) |
Mir-210-v1
supercont1.512: 515646-515703 [-]
Ensembl
Mir-210-v2 supercont1.512: 515646-515703 [-] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCCCGAAAUCAACCGUGUGAAUCUCAUUGCAGCUGCUGACCACUGCACAAGAUUAGAUUAUGACUCUUGUGCGUGUGACAACGGCUAUUGUGGGCAUUCCGAGUCAUCCAAGGAAAAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UCCCGAAAUCAACCGUGU- -| UGC C AC - UUAGA GAAU CUCAU AGCUG UG CAC UGCACAAGA U CUUA GGGUG UCGGC AC GUG GCGUGUUCU U AAAAAGGAACCUACUGAGC C^ UUA A A- U CAGUA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Aae-Mir-210-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCUGCUGACCACUGCACAAGAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Aae-Mir-210-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014293 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CUUGUGCGUGUGACAACGGCUAU -58
Get sequence
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