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Hsa-Mir-28-P1

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

nerve

ratio co-mature/mature: 43004.0/156475.0 = 0.27
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 14216.0/49598.0 = 0.29

co-mature (isoform content): 24.84% (heterogeneous)
mature (isoform content): 24.07% (heterogeneous)

brain_arachnoid_matter

ratio co-mature/mature: 23383.0/79467.0 = 0.29
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 7356.0/27710.0 = 0.27

co-mature (isoform content): 23.93% (heterogeneous)
mature (isoform content): 25.85% (heterogeneous)

heart

ratio co-mature/mature: 77505.0/262579.0 = 0.3
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 30613.0/80751.0 = 0.38

co-mature (isoform content): 28.31% (heterogeneous)
mature (isoform content): 23.52% (heterogeneous)

trachea

ratio co-mature/mature: 13299.0/45254.0 = 0.29
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 6805.0/17291.0 = 0.39

co-mature (isoform content): 33.85% (heterogeneous)
mature (isoform content): 27.65% (heterogeneous)

X_DROSHA_knockout_2

ratio co-mature/mature: 25.0/5.0 = 5.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 11.0/0.0 = None

co-mature (isoform content): 30.56% (heterogeneous)
mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)

X_DROSHA_knockout_1

ratio co-mature/mature: 36.0/6.0 = 6.0
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 12.0/3.0 = 4.0

co-mature (isoform content): 25.0% (heterogeneous)
mature (isoform content): 33.33% (heterogeneous)

heart_atrium

ratio co-mature/mature: 22072.0/57781.0 = 0.38
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 8870.0/21973.0 = 0.4

co-mature (isoform content): 28.67% (heterogeneous)
mature (isoform content): 27.55% (heterogeneous)

lung

ratio co-mature/mature: 71084.0/219723.0 = 0.32
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 26811.0/65642.0 = 0.41

co-mature (isoform content): 27.39% (heterogeneous)
mature (isoform content): 23.0% (heterogeneous)

gallbladder

ratio co-mature/mature: 29620.0/104972.0 = 0.28
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 10314.0/32338.0 = 0.32

co-mature (isoform content): 25.83% (heterogeneous)
mature (isoform content): 23.55% (heterogeneous)

skin

ratio co-mature/mature: 39094.0/96390.0 = 0.41
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 15637.0/33907.0 = 0.46

co-mature (isoform content): 28.57% (heterogeneous)
mature (isoform content): 26.02% (heterogeneous)

esophagus

ratio co-mature/mature: 47395.0/185670.0 = 0.26
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 15009.0/47478.0 = 0.32

co-mature (isoform content): 24.05% (heterogeneous)
mature (isoform content): 20.36% (heterogeneous)

brain_nucleus_caudatus

ratio co-mature/mature: 6378.0/21217.0 = 0.3
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 1787.0/5834.0 = 0.31

co-mature (isoform content): 21.89% (heterogeneous)
mature (isoform content): 21.57% (heterogeneous)

kidney

ratio co-mature/mature: 30275.0/95163.0 = 0.32
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 10368.0/29782.0 = 0.35

co-mature (isoform content): 25.51% (heterogeneous)
mature (isoform content): 23.84% (heterogeneous)

brain_frontal_lobe

ratio co-mature/mature: 12950.0/47754.0 = 0.27
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 5282.0/14720.0 = 0.36

co-mature (isoform content): 28.97% (heterogeneous)
mature (isoform content): 23.56% (heterogeneous)

pleurae

ratio co-mature/mature: 26370.0/86061.0 = 0.31
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 9195.0/27685.0 = 0.33

co-mature (isoform content): 25.85% (heterogeneous)
mature (isoform content): 24.34% (heterogeneous)

testis

ratio co-mature/mature: 18087.0/44595.0 = 0.41
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 5968.0/15020.0 = 0.4

co-mature (isoform content): 24.81% (heterogeneous)
mature (isoform content): 25.2% (heterogeneous)

brain_grey_matter

ratio co-mature/mature: 8737.0/33157.0 = 0.26
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 3859.0/13200.0 = 0.29

co-mature (isoform content): 30.64% (heterogeneous)
mature (isoform content): 28.47% (heterogeneous)

brain_cerebellum

ratio co-mature/mature: 14538.0/54679.0 = 0.27
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 5274.0/14034.0 = 0.38

co-mature (isoform content): 26.62% (heterogeneous)
mature (isoform content): 20.42% (heterogeneous)

brain_temporal_lobe

ratio co-mature/mature: 23644.0/85845.0 = 0.28
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 8466.0/26892.0 = 0.31

co-mature (isoform content): 26.37% (heterogeneous)
mature (isoform content): 23.85% (heterogeneous)

spinal_cord

ratio co-mature/mature: 13141.0/34008.0 = 0.39
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 3472.0/9578.0 = 0.36

co-mature (isoform content): 20.9% (heterogeneous)
mature (isoform content): 21.97% (heterogeneous)

lymph_nodes

ratio co-mature/mature: 17938.0/74061.0 = 0.24
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 7290.0/24171.0 = 0.3

co-mature (isoform content): 28.9% (heterogeneous)
mature (isoform content): 24.61% (heterogeneous)

heart_muscle

ratio co-mature/mature: 32683.0/101808.0 = 0.32
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 13396.0/32208.0 = 0.42

co-mature (isoform content): 29.07% (heterogeneous)
mature (isoform content): 24.03% (heterogeneous)

heart_ventricle

ratio co-mature/mature: 10996.0/47759.0 = 0.23
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 4038.0/11471.0 = 0.35

co-mature (isoform content): 26.86% (heterogeneous)
mature (isoform content): 19.37% (heterogeneous)

brain_thalamus

ratio co-mature/mature: 14494.0/43740.0 = 0.33
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 4875.0/9158.0 = 0.53

co-mature (isoform content): 25.17% (heterogeneous)
mature (isoform content): 17.31% (heterogeneous)

bowel_jejunum

ratio co-mature/mature: 14355.0/62165.0 = 0.23
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 5532.0/21797.0 = 0.25

co-mature (isoform content): 27.82% (heterogeneous)
mature (isoform content): 25.96% (heterogeneous)

brain_occipital

ratio co-mature/mature: 38255.0/105366.0 = 0.36
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 12611.0/20623.0 = 0.61

co-mature (isoform content): 24.79% (heterogeneous)
mature (isoform content): 16.37% (heterogeneous)

submandibular_gland

ratio co-mature/mature: 14158.0/56724.0 = 0.25
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 5397.0/12746.0 = 0.42

co-mature (isoform content): 27.6% (heterogeneous)
mature (isoform content): 18.35% (heterogeneous)

brain_white_matter

ratio co-mature/mature: 11392.0/40745.0 = 0.28
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 3482.0/12134.0 = 0.29

co-mature (isoform content): 23.41% (heterogeneous)
mature (isoform content): 22.95% (heterogeneous)

stomach

ratio co-mature/mature: 64661.0/177667.0 = 0.36
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 21009.0/49836.0 = 0.42

co-mature (isoform content): 24.52% (heterogeneous)
mature (isoform content): 21.91% (heterogeneous)

X_XPO_knockout_1

ratio co-mature/mature: 10574.0/2556.0 = 4.14
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 2351.0/208.0 = 11.3

co-mature (isoform content): 18.19% (heterogeneous)
mature (isoform content): 7.53% (homogeneous)

bowel_small_intestine

ratio co-mature/mature: 30978.0/135826.0 = 0.23
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 10092.0/39121.0 = 0.26

co-mature (isoform content): 24.57% (heterogeneous)
mature (isoform content): 22.36% (heterogeneous)

X_XPO_knockout_2

ratio co-mature/mature: 8523.0/2338.0 = 3.65
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 2073.0/277.0 = 7.48

co-mature (isoform content): 19.56% (heterogeneous)
mature (isoform content): 10.59% (heterogeneous)

bladder

ratio co-mature/mature: 118077.0/221697.0 = 0.53
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 40841.0/62089.0 = 0.66

co-mature (isoform content): 25.7% (heterogeneous)
mature (isoform content): 21.88% (heterogeneous)

liver

ratio co-mature/mature: 34212.0/148371.0 = 0.23
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 15582.0/49600.0 = 0.31

co-mature (isoform content): 31.29% (heterogeneous)
mature (isoform content): 25.05% (heterogeneous)

artery

ratio co-mature/mature: 91727.0/246066.0 = 0.37
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 28839.0/81308.0 = 0.35

co-mature (isoform content): 23.92% (heterogeneous)
mature (isoform content): 24.84% (heterogeneous)

tongue

ratio co-mature/mature: 8317.0/42473.0 = 0.2
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 3273.0/10394.0 = 0.31

co-mature (isoform content): 28.24% (heterogeneous)
mature (isoform content): 19.66% (heterogeneous)

vein

ratio co-mature/mature: 51563.0/224295.0 = 0.23
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 17416.0/52373.0 = 0.33

co-mature (isoform content): 25.25% (heterogeneous)
mature (isoform content): 18.93% (heterogeneous)

pancreas

ratio co-mature/mature: 37839.0/136706.0 = 0.28
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 10676.0/39307.0 = 0.27

co-mature (isoform content): 22.01% (heterogeneous)
mature (isoform content): 22.33% (heterogeneous)

placenta

ratio co-mature/mature: 189468.0/34382.0 = 5.51
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 246415.0/15626.0 = 15.77

co-mature (isoform content): 56.53% (heterogeneous)
mature (isoform content): 31.25% (heterogeneous)

muscle

ratio co-mature/mature: 28209.0/105888.0 = 0.27
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 9899.0/30340.0 = 0.33

co-mature (isoform content): 25.98% (heterogeneous)
mature (isoform content): 22.27% (heterogeneous)

spleen

ratio co-mature/mature: 25788.0/65200.0 = 0.4
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 7714.0/17781.0 = 0.43

co-mature (isoform content): 23.03% (heterogeneous)
mature (isoform content): 21.43% (heterogeneous)

brain_dura_matter

ratio co-mature/mature: 25700.0/89675.0 = 0.29
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 9063.0/19249.0 = 0.47

co-mature (isoform content): 26.07% (heterogeneous)
mature (isoform content): 17.67% (heterogeneous)

bowel_duodenum

ratio co-mature/mature: 30270.0/85622.0 = 0.35
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 8754.0/23697.0 = 0.37

co-mature (isoform content): 22.43% (heterogeneous)
mature (isoform content): 21.68% (heterogeneous)

brain_pituitary

ratio co-mature/mature: 3492.0/13093.0 = 0.27
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 1146.0/3596.0 = 0.32

co-mature (isoform content): 24.71% (heterogeneous)
mature (isoform content): 21.55% (heterogeneous)

adipocyte

ratio co-mature/mature: 27412.0/115331.0 = 0.24
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 9589.0/31310.0 = 0.31

co-mature (isoform content): 25.92% (heterogeneous)
mature (isoform content): 21.35% (heterogeneous)

bowel_colon

ratio co-mature/mature: 62020.0/225119.0 = 0.28
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 17293.0/57113.0 = 0.3

co-mature (isoform content): 21.8% (heterogeneous)
mature (isoform content): 20.24% (heterogeneous)

thyroid

ratio co-mature/mature: 18249.0/57081.0 = 0.32
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 6123.0/17014.0 = 0.36

co-mature (isoform content): 25.12% (heterogeneous)
mature (isoform content): 22.96% (heterogeneous)

X_DCR_knockout_1

ratio co-mature/mature: 22.0/274.0 = 0.08
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 0.0/5.0 = 0.0

co-mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
mature (isoform content): 1.79% (homogeneous)

X_DCR_knockout_2

ratio co-mature/mature: 12.0/464.0 = 0.03
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 3.0/18.0 = 0.17

co-mature (isoform content): 20.0% (heterogeneous)
mature (isoform content): 3.73% (homogeneous)

heart_pericardium

ratio co-mature/mature: 11641.0/55139.0 = 0.21
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 3524.0/14467.0 = 0.24

co-mature (isoform content): 23.24% (heterogeneous)
mature (isoform content): 20.78% (heterogeneous)

bone

ratio co-mature/mature: 18934.0/57688.0 = 0.33
ratio co-mature (mismatch)/mature (mismatch): 5923.0/16659.0 = 0.36

co-mature (isoform content): 23.83% (heterogeneous)
mature (isoform content): 22.41% (heterogeneous)

nerve

ratio co-mature/mature: 43004.0/156475.0 = 0.27

brain_arachnoid_matter

ratio co-mature/mature: 23383.0/79467.0 = 0.29

heart

ratio co-mature/mature: 77505.0/262579.0 = 0.3

trachea

ratio co-mature/mature: 13299.0/45254.0 = 0.29

X_DROSHA_knockout_2

ratio co-mature/mature: 25.0/5.0 = 5.0

X_DROSHA_knockout_1

ratio co-mature/mature: 36.0/6.0 = 6.0

heart_atrium

ratio co-mature/mature: 22072.0/57781.0 = 0.38

lung

ratio co-mature/mature: 71084.0/219723.0 = 0.32

gallbladder

ratio co-mature/mature: 29620.0/104972.0 = 0.28

skin

ratio co-mature/mature: 39094.0/96390.0 = 0.41

esophagus

ratio co-mature/mature: 47395.0/185670.0 = 0.26

brain_nucleus_caudatus

ratio co-mature/mature: 6378.0/21217.0 = 0.3

kidney

ratio co-mature/mature: 30275.0/95163.0 = 0.32

brain_frontal_lobe

ratio co-mature/mature: 12950.0/47754.0 = 0.27

pleurae

ratio co-mature/mature: 26370.0/86061.0 = 0.31

testis

ratio co-mature/mature: 18087.0/44595.0 = 0.41

brain_grey_matter

ratio co-mature/mature: 8737.0/33157.0 = 0.26

brain_cerebellum

ratio co-mature/mature: 14538.0/54679.0 = 0.27

brain_temporal_lobe

ratio co-mature/mature: 23644.0/85845.0 = 0.28

spinal_cord

ratio co-mature/mature: 13141.0/34008.0 = 0.39

lymph_nodes

ratio co-mature/mature: 17938.0/74061.0 = 0.24

heart_muscle

ratio co-mature/mature: 32683.0/101808.0 = 0.32

heart_ventricle

ratio co-mature/mature: 10996.0/47759.0 = 0.23

brain_thalamus

ratio co-mature/mature: 14494.0/43740.0 = 0.33

bowel_jejunum

ratio co-mature/mature: 14355.0/62165.0 = 0.23

brain_occipital

ratio co-mature/mature: 38255.0/105366.0 = 0.36

submandibular_gland

ratio co-mature/mature: 14158.0/56724.0 = 0.25

brain_white_matter

ratio co-mature/mature: 11392.0/40745.0 = 0.28

stomach

ratio co-mature/mature: 64661.0/177667.0 = 0.36

X_XPO_knockout_1

ratio co-mature/mature: 10574.0/2556.0 = 4.14

bowel_small_intestine

ratio co-mature/mature: 30978.0/135826.0 = 0.23

X_XPO_knockout_2

ratio co-mature/mature: 8523.0/2338.0 = 3.65

bladder

ratio co-mature/mature: 118077.0/221697.0 = 0.53

liver

ratio co-mature/mature: 34212.0/148371.0 = 0.23

artery

ratio co-mature/mature: 91727.0/246066.0 = 0.37

tongue

ratio co-mature/mature: 8317.0/42473.0 = 0.2

vein

ratio co-mature/mature: 51563.0/224295.0 = 0.23

pancreas

ratio co-mature/mature: 37839.0/136706.0 = 0.28

placenta

ratio co-mature/mature: 189468.0/34382.0 = 5.51

muscle

ratio co-mature/mature: 28209.0/105888.0 = 0.27

spleen

ratio co-mature/mature: 25788.0/65200.0 = 0.4

brain_dura_matter

ratio co-mature/mature: 25700.0/89675.0 = 0.29

bowel_duodenum

ratio co-mature/mature: 30270.0/85622.0 = 0.35

brain_pituitary

ratio co-mature/mature: 3492.0/13093.0 = 0.27

adipocyte

ratio co-mature/mature: 27412.0/115331.0 = 0.24

bowel_colon

ratio co-mature/mature: 62020.0/225119.0 = 0.28

thyroid

ratio co-mature/mature: 18249.0/57081.0 = 0.32

X_DCR_knockout_1

ratio co-mature/mature: 22.0/274.0 = 0.08

X_DCR_knockout_2

ratio co-mature/mature: 12.0/464.0 = 0.03

heart_pericardium

ratio co-mature/mature: 11641.0/55139.0 = 0.21

bone

ratio co-mature/mature: 18934.0/57688.0 = 0.33

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