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Cgi-Mir-9-P18

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both truncated	5' elongated	3' elongated	both elongated	5' truncated	3' truncated	canonical
both truncated mismatch	5' elongated mismatch	3' elongated mismatch	both elongated mismatch	5' truncated mismatch	3' truncated mismatch	canonical mismatch

Mantle_inner

ratio mature/star: 68.0/29.0 = 2.34
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.0/2.0 = 0.5

mature (isoform content): 1.45% (homogeneous)
star (isoform content): 6.45% (homogeneous)

Juvenile

ratio mature/star: 82.0/15.0 = 5.47
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4.0/3.0 = 1.33

mature (isoform content): 4.65% (homogeneous)
star (isoform content): 16.67% (heterogeneous)

D-shape

ratio mature/star: 10682.0/5047.0 = 2.12
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 158.0/781.0 = 0.2

mature (isoform content): 1.46% (homogeneous)
star (isoform content): 13.4% (heterogeneous)

D-gland

ratio mature/star: 5.0/4.0 = 1.25
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

L-palps

ratio mature/star: 18.0/19.0 = 0.95
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 1.0/0.0 = None

mature (isoform content): 5.26% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

Egg

ratio mature/star: 1.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): None

A-muscle

ratio mature/star: 0.0/1.0 = 0.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): None
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

late

ratio mature/star: 1758.0/2309.0 = 0.76
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 49.0/102.0 = 0.48

mature (isoform content): 2.71% (homogeneous)
star (isoform content): 4.23% (homogeneous)

F-gonad

ratio mature/star: 1.0/2.0 = 0.5
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

Pediveliger

ratio mature/star: 1144.0/382.0 = 2.99
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 46.0/25.0 = 1.84

mature (isoform content): 3.87% (homogeneous)
star (isoform content): 6.14% (homogeneous)

haemocytes

ratio mature/star: 217.0/241.0 = 0.9
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 3.0/4.0 = 0.75

mature (isoform content): 1.36% (homogeneous)
star (isoform content): 1.63% (homogeneous)

female

ratio mature/star: 1.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): None

Umbo

ratio mature/star: 991.0/320.0 = 3.1
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 48.0/88.0 = 0.55

mature (isoform content): 4.62% (homogeneous)
star (isoform content): 21.57% (heterogeneous)

early

ratio mature/star: 2697.0/849.0 = 3.18
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 37.0/31.0 = 1.19

mature (isoform content): 1.35% (homogeneous)
star (isoform content): 3.52% (homogeneous)

Mantle_outer

ratio mature/star: 32.0/32.0 = 1.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4.0/4.0 = 1.0

mature (isoform content): 11.11% (heterogeneous)
star (isoform content): 11.11% (heterogeneous)

male

ratio mature/star: 2.0/1.0 = 2.0
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): 0.0% (homogeneous)

Remainder

ratio mature/star: 2.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): None

Hemolymph

ratio mature/star: 1.0/0.0 = None
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 0.0/0.0 = None

mature (isoform content): 0.0% (homogeneous)
star (isoform content): None

Spat

ratio mature/star: 181.0/33.0 = 5.48
ratio mature (mismatch)/star (mismatch): 4.0/3.0 = 1.33

mature (isoform content): 2.16% (homogeneous)
star (isoform content): 8.33% (homogeneous)

Mantle_inner

ratio mature/star: 68.0/29.0 = 2.34

Juvenile

ratio mature/star: 82.0/15.0 = 5.47

D-shape

ratio mature/star: 10682.0/5047.0 = 2.12

D-gland

ratio mature/star: 5.0/4.0 = 1.25

L-palps

ratio mature/star: 18.0/19.0 = 0.95

Egg

ratio mature/star: 1.0/0.0 = None

A-muscle

ratio mature/star: 0.0/1.0 = 0.0

late

ratio mature/star: 1758.0/2309.0 = 0.76

F-gonad

ratio mature/star: 1.0/2.0 = 0.5

Pediveliger

ratio mature/star: 1144.0/382.0 = 2.99

haemocytes

ratio mature/star: 217.0/241.0 = 0.9

female

ratio mature/star: 1.0/0.0 = None

Umbo

ratio mature/star: 991.0/320.0 = 3.1

early

ratio mature/star: 2697.0/849.0 = 3.18

Mantle_outer

ratio mature/star: 32.0/32.0 = 1.0

male

ratio mature/star: 2.0/1.0 = 2.0

Remainder

ratio mature/star: 2.0/0.0 = None

Hemolymph

ratio mature/star: 1.0/0.0 = None

Spat

ratio mature/star: 181.0/33.0 = 5.48

Reads

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-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	U	A	A	A	G	C	U	A	U	G	C	U	A	C	C	G	G	A	G	G	C	U	U	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	62	12.29
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late	Xu et al. 2014	SRR317143
Pediveliger	Xu et al. 2014	SRR317152
A-muscle	Xu et al. 2014	SRR317138
early	Xu et al. 2014	SRR317142
Mantle_inner	Xu et al. 2014	SRR317135
D-shape	Xu et al. 2014	SRR317150
Mantle_outer	Xu et al. 2014	SRR317134
Spat	Xu et al. 2014	SRR317153
Egg	Xu et al. 2014	SRR317147
Hemolymph	Xu et al. 2014	SRR317139
Gill	Xu et al. 2014	SRR317137
Trochophore	Xu et al. 2014	SRR317149