| MirGeneDB ID | Tni-Mir-137-P3b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAUUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Pufferfish (Tetraodon nigroviridis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | tni-mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-137-P3-v1 Aca-Mir-137-P3-v2 Ami-Mir-137-P3-v1 Ami-Mir-137-P3-v2 Asu-Mir-137 Bfl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cgi-Mir-137 Cli-Mir-137-P3 Cpi-Mir-137-P3-v1 Cpi-Mir-137-P3-v2 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gga-Mir-137-P3-v1 Gga-Mir-137-P3-v2 Gja-Mir-137-P3 Gmo-Mir-137-P3b-v1 Gmo-Mir-137-P3b-v2 Hme-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lch-Mir-137-P3 Lgi-Mir-137 Loc-Mir-137-P3-v1 Loc-Mir-137-P3-v2 Mal-Mir-137-P3b-v1 Mal-Mir-137-P3b-v2 Mdo-Mir-137-P3-v1 Mdo-Mir-137-P3-v2 Mun-Mir-137-P3 Oan-Mir-137-P3-v1 Oan-Mir-137-P3-v2 Obi-Mir-137 Pbv-Mir-137-P3-v1 Pbv-Mir-137-P3-v2 Pma-Mir-137-o3 Sha-Mir-137-P3 Sko-Mir-137 Spu-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Tetraodon_nigroviridis.TETRAODON8.dna.toplevel) |
18: 4783334-4783392 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGGACAGCCUCUAUGCUCCGAUCUCGACCACGGGUAUUCUUGGGUUGAUAAUACAGAUGUGGAUGUUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAGUCGAGUGGAUGCUUUAUCACCAAAAACUGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GAGGACAGCCUCUAUGC----| AU C G UG U ACAGA UCCG CUCGAC ACG GUAUUCU GGU GAUAAU U AGGU GAGCUG UGC CAUAAGA UCG UUAUUG G AGUCAAAAACCACUAUUUCGU^ -- A G GU - UAGGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Tni-Mir-137-P3b_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGGGUAUUCUUGGGUUGAUAAU -23
Get sequence
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| Mature sequence | Tni-Mir-137-P3b_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0002933 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UUAUUGCUUGAGAAUACGCGUAG -59
Get sequence
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