| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-879 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Rno-Mir-879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr5: 9375714-9375769 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAGAGAUUCACAAGACAAGUUUCUAGGUCCAGAGGCUUAUAGCUCUAAGCCUUGGAUGAAAGAGGCUUAUGGCUUCAAGCUUUCGGAGCUGGAGACUUACUGCUCUUCGUGGUCAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CAGAGAUUCACAAGACA--| G AG AU C UGGA AGUUUCUAG UCC AGGCUU AGCU UAAGCCU U UCAGAGGUC AGG UUCGAA UCGG AUUCGGA G AACUGGUGCUUCUCGUCAU^ G CU CU U GAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-879_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0004842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGAGGCUUAUAGCUCUAAGCCU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004842 TargetScanVert: mmu-miR-879-5p miRDB: MIMAT0004842 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-879_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0004843 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- GCUUAUGGCUUCAAGCUUUCGG -56
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004843 TargetScanVert: mmu-miR-879-3p miRDB: MIMAT0004843 |
