| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-674 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CACUGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Rno-Mir-674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Muridae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr2: 117185151-117185207 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CCAGUUGGCCUAGUCAUCACCCUGAGCCUUGCACUGAGAUGGGAGUGGUGUAAGGCUCAGGUAUGCACAGCUCCCAUCUCAGAACAAGGCUCGGGUGUGCUCAGCUCCCAUCUCAUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CCAGUUGGCCUAGUCAU- -| CA G AGGCU CAC CCUGAGCCUUG CUGAGAUGGGAGU GUGUA \ GUG GGGCUCGGAAC GACUCUACCCUCG CACGU C CUACUCUACCCUCGACUC U^ AA A AUGGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-674_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0003740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GCACUGAGAUGGGAGUGGUGUA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003740 TargetScanVert: mmu-miR-674-5p miRDB: MIMAT0003740 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-674_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0003741 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CACAGCUCCCAUCUCAGAACAA -57
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003741 TargetScanVert: mmu-miR-674-3p miRDB: MIMAT0003741 |
