| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-6715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-6715 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGGCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-6715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-6715 Cfa-Mir-6715 Cpo-Mir-6715 Ete-Mir-6715 Hsa-Mir-6715 Mml-Mir-6715 Ocu-Mir-6715 Rno-Mir-6715 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr19: 55192678-55192734 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCCAAUAUGUGUACUCCUGGGCUGUGUCCACAGGCACCACAGGUUUGAGCAUUUUGAUUGAAUUGCCAAACCAGGCGUGCCUGUGGACACAGCACUCACGGGCUCCUUGAGUGCCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 GCCCAAUAUGUGUACUCCUGG--| CACA A UUUUG GCUGUGUCCACAGGCAC GGUUUG GCA A CGACACAGGUGUCCGUG CCAAAC CGU U GCCGUGAGUUCCUCGGGCACUCA^ CGGA - UAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-6715_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0029876 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACAGGCACCACAGGUUUGAGCA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-6715-5p miRDB: MIMAT0029876 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-6715_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0029877 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCAAACCAGGCGUGCCUGUGG -57
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-6715-3p miRDB: MIMAT0029877 |
