| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-326 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCUGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-326 Cfa-Mir-326 Cpo-Mir-326 Dno-Mir-326 Ete-Mir-326 Hsa-Mir-326 Mml-Mir-326 Ocu-Mir-326 Rno-Mir-326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr7: 99552287-99552347 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACUCUUCCGAGCCUCAUCUGUCUGUUGGGCUGGGGGCAGGGCCUUUGUGAAGGCGGGUUAUGCUCAGAUCGCCUCUGGGCCCUUCCUCCAGUCCCGAGGCAGAUUUACUUCGAGGCAAAACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 ACUCUUCCGAGCCUCAU--| GUU C UUGUGA GGUUAU CUGUCU GGGCUGGGGG AGGGCCU AGGCG G GACGGA CCUGACCUCC UCCCGGG UCCGC C CAAAACGGAGCUUCAUUUA^ GC- U UC---- UAGACU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | This is likely a group 2 miRNA given the orthologues in other mammals but here the 3' terminal U on the 3p arm is templated. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-326_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGGGGCAGGGCCUUUGUGAAGGCG -25
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-326-5p miRDB: MIMAT0017027 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-326_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG -61
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000559 TargetScanVert: mmu-miR-326-3p miRDB: MIMAT0000559 |
