| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3092 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAUGGGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3092 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr3: 27584915-27584979 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCUGGCAAAACUGUAAGAGGCUGGACCUGAGGGGAAAAUGCCUUUCUCCCAGUUUCCUGAUCUUUGUGUCUGGGAAUGGGGCUGUUUCCCCUCCUGUCCUGCAAUCUUAUUCCAGCCCAAGGCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCCUGGCAAAACUGUAAGAG--| U CU AU UC AGUUUCCUGA GC GGAC GAGGGGAAA GCCUU UCCC \ CG CCUG CUCCCCUUU CGGGG AGGG U UCGGAACCCGACCUUAUUCUAA^ U UC GU UA UCUGUGUUUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-3092_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014905 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGGGAAAAUGCCUUUCUCCC -21
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3092-5p miRDB: MIMAT0014905 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3092_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0014906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- GAAUGGGGCUGUUUCCCCUCC -65
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3092-3p miRDB: MIMAT0014906 |






