| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3058 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CAGCCAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr10: 95559243-95559308 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGAUUUCGGGAUAAUUCUCCAGCGUUGGAGUCAGCCACGGCUUACCUGGAAGAUUGAAUGUCUACUUGGCUUUCUUCCUGUCAGCCGUGGGUGCCUCUUGCUACUGGAAGAGCUCUGUGAUGGUUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGAUUUCGGGAUAAUUC- C-| U U G U CU UUGAAUGUC UCCAG GU GGAG CA CCACGGCU AC GGAAGA \ AGGUC CG UCUC GU GGUGCCGA UG CCUUCU U CUUGGUAGUGUCUCGAGA AU^ U C G C U- UUCGGUUCA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3058_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014813 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCAGCCACGGCUUACCUGGAAGA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3058-5p miRDB: MIMAT0014813 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-3058_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- UUCCUGUCAGCCGUGGGUGCCU -66
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3058-3p miRDB: MIMAT0014814 |
