| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-3057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-3057 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUGGAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-3057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr10: 81271610-81271675 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAAACCUUGAGGUGUCCUGAAGGUGUGUGCAUUGGAGCUGAGAUUCUGCGGGAUGGAUUAGGAGUAUAUUGUCCUCCCACAGGCCCAGCUCAUAGCACAAGCCAUCGGCCAGGCCUUCAGCAUCGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAACCUUGAGGUGUCC--| A G AUUG AGAU C UGGAUUAGGA UGA GGU UGUGC GAGCUG UCUG GGGA \ GCU CCG ACACG CUCGAC GGAC CCCU G CGCUACGACUUCCGGACCG^ A A AUA- CC-- A CCUGUUAUAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-3057_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014822 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUUGGAGCUGAGAUUCUGCGGGAU -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3057-5p miRDB: MIMAT0014822 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-3057_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UCCUCCCACAGGCCCAGCUCAUAGC -66
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-3057-3p miRDB: MIMAT0014823 |
