| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1934 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAUGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1934 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr11: 69663055-69663113 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAAAAGAGCCAUUCCGAGCUGGGCCUUCUUUCUGGUCCCCUGCUUCGUCCUCUGUCCAGAUGUUAAGAGGAUGACGGUGGGGCUGGUGAGAUGGCUCAGCGGUUAAGAGCGCCGAUUGCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CAAAAGAGCCAUUCCGA-- U U UG -| CU GUCCA GCUGGGCC UCUU C GUCCC CUG UCGUCCUCU G CGACUCGG AGAG G CGGGG GGC AGUAGGAGA A CGUUAGCCGCGAGAAUUGG U U GU U^ -- AUUGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-1934_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0009398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UCUGGUCCCCUGCUUCGUCCUCU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0009398 TargetScanVert: mmu-miR-1934-5p miRDB: MIMAT0009398 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1934_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0017341 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AGGAUGACGGUGGGGCUGGUGA -59
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1934-3p miRDB: MIMAT0017341 |
