| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1930 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCUCCAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | M. musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr10: 77641236-77641295 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCAUAGGAGCUGGACCACAUGCCCACGGUCACCUCCAUAGUACCUGCAGCGUGCUUGACUUUCUCUAUGGUGCAGUUACUGUGGCUGUGGCUGUGUUCGUGCCUCAGACUGAAAAGGACUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UCAUAGGAGCUGGACCA--| CC CU C G GCUUGA CAUG CACGGUCAC CCAUAGUA CUGCA CGU C GUGC GUGUCGGUG GGUGUCAU GACGU GUA U UCAGGAAAAGUCAGACUCC^ UU UC U G UCUCUU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1930_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009393 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACCUCCAUAGUACCUGCAGCGU -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0009393 TargetScanVert: mmu-miR-1930-5p miRDB: MIMAT0009393 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-1930_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017340 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- GGUGCAGUUACUGUGGCUGUGG -60
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1930-3p miRDB: MIMAT0017340 |
