| MirGeneDB ID | Lpo-Mir-29-P2n | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-29 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGCACCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lpo-Mir-29-P2m | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Asu-Mir-29-P2 Bfl-Mir-29-P2 Bla-Mir-29-P2 Cbr-Mir-29-P2 Cel-Mir-29-P2 Cgi-Mir-29-P2 Cin-Mir-29-P2 Csc-Mir-29-P2 Cte-Mir-29-P2 Esc-Mir-29-P2 Isc-Mir-29-P2 Lgi-Mir-29-P2 Npo-Mir-29-P2 Obi-Mir-29-P2 Ovu-Mir-29-P2 Pfl-Mir-29-P2 Pmi-Mir-29-P2 Sko-Mir-29-P2 Spu-Mir-29-P2 Xbo-Mir-29-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013673387.1: 33099-33157 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUAACAAGGUGUUUCUCUAUCUUUGGGUCACUGGGUUCGUAUGGUACAUAGAUGCAUUAGCAACUCUAGCACCAUUAGAAUUCAGUUCAUCCAGAGAUCGUGUGCUGCUCAGGAAGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUUAACAAGGUGUUUCUCU- C-| GU ACA UGCAU AUCUUUGGGU ACUGGGUUC AUGGU UAGA U UAGAGACCUA UGACUUAAG UACCA AUCU A AAGAAGGACUCGUCGUGUGC CU^ AU CG- CAACG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lpo-Mir-29-P2n_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACUGGGUUCGUAUGGUACAUAGA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Lpo-Mir-29-P2n_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UAGCACCAUUAGAAUUCAGUUC -59
Get sequence
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