| MirGeneDB ID | Lpo-Mir-193-P1t | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-193 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | ACUGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Atlantic horseshoe crab (Limulus polyphemus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lpo-Mir-193-P1r Lpo-Mir-193-P1s Lpo-Mir-193-P2n Lpo-Mir-193-P2o Lpo-Mir-193-P2r | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-193-P1 Bge-Mir-193-P1 Cbr-Mir-193-P1-v1 Cbr-Mir-193-P1-v2 Cel-Mir-193-P1-v1 Cel-Mir-193-P1-v2 Cgi-Mir-193-P1 Cte-Mir-193-P1 Dan-Mir-193-P1-v1 Dan-Mir-193-P1-v2 Dan-Mir-193-P1-v3 Dan-Mir-193-P1-v4 Dma-Mir-193-P1 Dme-Mir-193-P1-v1 Dme-Mir-193-P1-v2 Dme-Mir-193-P1-v3 Dme-Mir-193-P1-v4 Dmo-Mir-193-P1-v1 Dmo-Mir-193-P1-v2 Dmo-Mir-193-P1-v3 Dmo-Mir-193-P1-v4 Dpu-Mir-193-P1 Dsi-Mir-193-P1-v1 Dsi-Mir-193-P1-v2 Dsi-Mir-193-P1-v3 Dsi-Mir-193-P1-v4 Dya-Mir-193-P1-v1 Dya-Mir-193-P1-v2 Dya-Mir-193-P1-v3 Dya-Mir-193-P1-v4 Esc-Mir-193-P1 Hme-Mir-193-P1 Isc-Mir-193-P1 Lgi-Mir-193-P1 Npo-Mir-193-P1 Obi-Mir-193-P1 Ovu-Mir-193-P1 Pma-Mir-193-P1 Pmi-Mir-193-P1 Tca-Mir-193-P1 Xbo-Mir-193-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. polyphemus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000517525.1_Limulus_polyphemus-2.1.2_genomic) |
NW_013674669.1: 30191-30255 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGGGGAAAAAAAAGUGUGAUGCGUAGCGCCCGGGUCUUAGUGGUACAGUGGGCCUCAGUCGCUUCGGCACGUCUACUGGCCUACUAAGUCCCAAGCGCUGCGUGUUUCCAUCUCCAGUAACACCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGGGGAAAAAAAAGUGU--| CC U UA CCUCAGUCG GAUGCGUAGCGC GGG CUUAGUGG CAGUGGG \ UUGUGCGUCGCG CCC GAAUCAUC GUCAUCU C ACCACAAUGACCUCUACCU^ AA U CG GCACGGCUU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lpo-Mir-193-P1t_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CGGGUCUUAGUGGUACAGUGGG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Lpo-Mir-193-P1t_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- UACUGGCCUACUAAGUCCCAAG -65
Get sequence
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