| MirGeneDB ID | Lgi-Mir-281-P9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-281 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUCAUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Owl limpet (Lottia gigantea) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | lgi-mir-281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Lgi-Mir-281-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-281 Asu-Mir-281 Bfl-Mir-281 Bge-Mir-281 Bla-Mir-281 Bpl-Mir-281 Cgi-Mir-281 Cin-Mir-281 Csc-Mir-281 Cte-Mir-281 Dma-Mir-281 Dpu-Mir-281 Ebu-Mir-281 Esc-Mir-281 Hme-Mir-281 Isc-Mir-281 Lan-Mir-281-P9 Npo-Mir-281 Obi-Mir-281 Ovu-Mir-281 Pfl-Mir-281 Sko-Mir-281 Sme-Mir-281 Sto-Mir-281 Tca-Mir-281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. gigantea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Lotgi1) |
LOTGIsca_7: 642928-642984 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCGAUUUUCAAGAUUCAAGAUCAAACGAUGAAGGGAGCAUCUGUCGACAGUUUGAAUUUAAAUACUGUCAUGGAGUUGCUCUCUUUACCGGGUUGGUCAAAUUCACCGAAAGUAAGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UCGAUUUUCAAGAUUCAA- A- A --| C UUGAA GAUCAA CG UGAAGGGAGCA UCUGU GACAGU U CUGGUU GC AUUUCUCUCGU AGGUA CUGUCA U UGAAUGAAAGCCACUUAAA GG C UG^ - UAAAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Lgi-Mir-281-P9_5p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0009594 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGGGAGCAUCUGUCGACAGU -21
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Lgi-Mir-281-P9_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | MIMAT0009595 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UGUCAUGGAGUUGCUCUCUUUA -57
Get sequence
|
