| MirGeneDB ID | Dno-Mir-876 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-876 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGUGGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-876 Cfa-Mir-876 Cpo-Mir-876 Ete-Mir-876 Hsa-Mir-876 Mml-Mir-876 Ocu-Mir-876 Rno-Mir-876 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH581283: 622706-622764 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-876) |
Mir-873-v1
JH581283: 597023-597081 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-873-v2 JH581283: 597024-597080 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAAGUCUUAAAGAAACUGUUAAGUGCUGUGGAUUUCUUUGUGAAUCACCAUAUCUAAACUAGUGUGGUGGUGGUUUACAAAGUAAUUCAUAGUGCUUCACAGGUACUUCUGCAGUUGAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CAAGUCUUAAAGAAACU--| U UG U AUCUAAA GU AAG CUGUGGAUU CUUUGUGAAUCACCAU \ CA UUC GAUACUUAA GAAACAUUUGGUGGUG C UAGUUGACGUCUUCAUGGA^ C GU U GUGUGAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-876_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAUUUCUUUGUGAAUCACCAUA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-876_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UGGUGGUUUACAAAGUAAUUCA -59
Get sequence
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