| MirGeneDB ID | Dme-Mir-1175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1175 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGAUUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-958 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-1175 Asu-Mir-1175 Bge-Mir-1175 Bpl-Mir-1175 Cgi-Mir-1175 Cte-Mir-1175 Dan-Mir-1175 Dma-Mir-1175 Dmo-Mir-1175 Dpu-Mir-1175 Dsi-Mir-1175 Dya-Mir-1175-P3 Dya-Mir-1175-P4 Efe-Mir-1175-P1 Efe-Mir-1175-P2 Hme-Mir-1175 Isc-Mir-1175 Lan-Mir-1175 Lgi-Mir-1175 Lpo-Mir-1175-P5 Lpo-Mir-1175-P6 Lpo-Mir-1175-P7 Npo-Mir-1175 Obi-Mir-1175 Ovu-Mir-1175 Sme-Mir-1175-P8 Sme-Mir-1175-P9 Tca-Mir-1175 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
3L: 22669302-22669365 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGAUUUUCCACGAUCGGCGUGUCUAUGGCAAGUAGAAUAGCAGGCUUAUCACAUGUUUAAUUCAAUCUGCUGUGAGAUUCUUCUAUUCUACUUUCGACAACACCCGUUAACAUCACACCCGACCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GGAUUUUCCACGAUCGGC---| CUA C C CUUA UGUUUAAU GUGU UGG AAGUAGAAUAG AGG UCACA \ CACA GCU UUCAUCUUAUC UCU AGUGU U CCAGCCCACACUACAAUUGCC^ ACA - U UAG- CGUCUAAC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-1175_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020852 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUAGAAUAGCAGGCUUAUCACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-1175_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005471 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
42- UGAGAUUCUUCUAUUCUACUUU -64
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005471 TargetScanFly: dme-miR-958 |
