| MirGeneDB ID | Cpo-Mir-95-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-95 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cpo-mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cpo-Mir-95-P1 Cpo-Mir-95-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-95-P4 Cfa-Mir-95-P4 Ete-Mir-95-P4 Hsa-Mir-95-P4 Mml-Mir-95-P4 Mmu-Mir-95-P4 Ocu-Mir-95-P4 Rno-Mir-95-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (cavPor3) |
scaffold_46: 5270718-5270780 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAUUGUGUUUCUUCAUGCCUGGCAUAUAGCAGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUUGAAAAAAUAAAUGAAUCAACAAGUCUUAUUUGAGCACCUGUUAUGUGUAGGAUAAAAAACUACGACUCAGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAUUGUGUUUCUUCAUG---| G C - U GAAAAAAU CCUG CAUAUAGCAGGU CUCAA UAAG AUUUGUU \ GGAU GUGUAUUGUCCA GAGUU AUUC UGAACAA A AGACUCAGCAUCAAAAAAUA^ - C U - CUAAGUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cpo-Mir-95-P4_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cpo-Mir-95-P4_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAAGUCUUAUUUGAGCACCUGU -63
Get sequence
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