| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-8908-P4c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-8908 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAGCGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Cfa-Mir-8908-P1a1 Cfa-Mir-8908-P1a2 Cfa-Mir-8908-P1b Cfa-Mir-8908-P1c Cfa-Mir-8908-P1d Cfa-Mir-8908-P2 Cfa-Mir-8908-P3 Cfa-Mir-8908-P4a1 Cfa-Mir-8908-P4a2 Cfa-Mir-8908-P4b Cfa-Mir-8908-P5 Cfa-Mir-8908-P6 Cfa-Mir-8908-P7 Cfa-Mir-8908-P8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | C. familiaris | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | C. familiaris | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chrUn_JH373668: 23687-23747 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCUCCUGCGGGCCACACUGAGUUUGGGGUCCUACCCAGAAAAGUGCUGAUGAAGCAGGAUACGGAUUAUUAGCGCCUGACUGAGUGGGGUCCCAAUCAGUAACAUAACUGCCCGUGGUGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CUCUCCUGCGGGCCACA----| GU GU C AAAA AAGCAGG CUGA UUGGG CCUAC CAG GUGCUGAUG \ GACU AACCC GGGUG GUC CGCGAUUAU A UGUGGUGCCCGUCAAUACAAU^ -- UG A AGUC UAGGCAU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cfa-Mir-8908-P4c_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCUACCCAGAAAAGUGCUGAUG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cfa-Mir-8908-P4c_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUAGCGCCUGACUGAGUGGGGU -61
Get sequence
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