| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-769 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-769 Cpo-Mir-769 Dno-Mir-769 Ete-Mir-769 Hsa-Mir-769 Mml-Mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr1: 109618366-109618426 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGACCUGGUGCUGAUUCCUGCGCUCUGACCUGAGACCUCUGGGUUCUGAGCUGUGAUGUUCCUUCCAAGCUGGGAUCUCUGGGGUCUUGGUUCAGGGUCGGGGCCUCUGGGUUAUGAGCACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGACCUGGUGCUGAUUC- G -| C UG U U G GUGAUGU CU CG CUCUGA C AGACCUC GGG UCU AGCU \ GG GC GGGACU G UCUGGGG CUC AGG UCGA U CACGAGUAUUGGGUCUCC G U^ U GU U U G ACCUUCC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-769_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGACCUCUGGGUUCUGAGCU -22
Get sequence
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| Star sequence | Cfa-Mir-769_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0034400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CUGGGAUCUCUGGGGUCUUGGU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-769 miRDB: MIMAT0034400 |
