| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-6529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-6529 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGAGAUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-6529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-6529 Cpo-Mir-6529 Dno-Mir-6529 Ete-Mir-6529 Hsa-Mir-6529 Mml-Mir-6529 Ocu-Mir-6529 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr33: 23649328-23649388 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUAUCUUACAUGAGAAAAACCUGUUCUCUUGAGAGAUCAGAGGCGCAGAGUGCGUCAAUGUCAAUGAAGCCUGUGCCUUUUACCUCUUUAAGAGCGCACGGUUUCAUUCUGCUUCUAAACCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AUAUCUUACAUGAGAAA- - U -| AUC A GCGUCAAU AACC UGU CUCUU GAGAG AGAGGCGCAG GU \ UUGG ACG GAGAA UUCUC UUUCCGUGUC CG G CCAAAUCUUCGUCUUACU C C U^ CAU - AAGUAACU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-6529_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGAGAUCAGAGGCGCAGAGU -21
Get sequence
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| Star sequence | Cfa-Mir-6529_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0034278 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CCUGUGCCUUUUACCUCUUUAA -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-6529 miRDB: MIMAT0034278 |
