| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-491 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUGGGGA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-491 Cpo-Mir-491 Dno-Mir-491 Hsa-Mir-491 Mml-Mir-491 Mmu-Mir-491 Ocu-Mir-491 Rno-Mir-491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr11: 40300966-40301021 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UACCUGCUGUGGGAAUUGACUUAGCUGGGUAGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGAGUAGAACACUCCUUAUGCAAGAUUCCCUUCUACCUGACUGGGUUGGAGUCCUAUCCUGUGCGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UACCUGCUGUGGGAAUU--| CU U CC C GUAG GACUUAG GGGUAG GGGGAA CUU CAUGAGGA \ UUGGGUC UCCAUC UCCCUU GAA GUAUUCCU A AGCGUGUCCUAUCCUGAGG^ AG U A- C CACA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-491_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUGGGGAACCCUUCCAUGAGGA -23
Get sequence
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| Star sequence | Cfa-Mir-491_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0006601 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- CUUAUGCAAGAUUCCCUUCUAC -56
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-491 miRDB: MIMAT0006601 |
