| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-350 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCACAAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-350 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cpo-Mir-350 Ete-Mir-350 Mmu-Mir-350 Ocu-Mir-350 Rno-Mir-350-P1 Rno-Mir-350-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr7: 34314836-34314896 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAAAAGCAAAACCUUUGCUCCUACAAGAGUAAAGUGCACGCGCUUUGGGACAGUGAAGAAAAUAAUGUUCACAAAGCCCAUACACUUUUACCCUUUAGGAGAGUUGCAACUUCUUUGACCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UAAAAGCAAAACCUUUG--- C A - CACGC -| GUGAAG CUCCUA AAG GU AAAGUG GCUUUG GGACA \ GAGGAU UUC CA UUUCAC CGAAAC CUUGU A ACCAGUUUCUUCAACGUUGA - C U AUACC A^ AAUAAA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cfa-Mir-350_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAAGUGCACGCGCUUUGGGACA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cfa-Mir-350_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0006704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UUCACAAAGCCCAUACACUUUUAC -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-350 miRDB: MIMAT0006704 |
