| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-346 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUCUGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-346 Cpo-Mir-346 Ete-Mir-346 Hsa-Mir-346 Mml-Mir-346 Mmu-Mir-346 Ocu-Mir-346 Rno-Mir-346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr4: 34073351-34073410 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUCGAGUGGGAGGUCUCUGUGGUGGGCGUCUGUCUGCCCGCAUGCCUGCCUCUUUGUUGCUCGGAAGGAGGCAGGGGCUGGGCCUGCAGCUGCCUGGGCAGAGCGGCUCCUGCGUGGGACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AUCGAGUGGGAGGUCUC---| GGU U CU - AUG UUGUUG UGU GGGCG CUGU GCCC GC CCUGCCUCU \ ACG UCCGU GACG CGGG CG GGACGGAGG C CAGGGUGCGUCCUCGGCGAG^ GG- C UC U G-- AAGGCU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-346_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0009898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGUCUGCCCGCAUGCCUGCCUCU -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-346 miRDB: MIMAT0009898 |
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| Star sequence | Cfa-Mir-346_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- AGGCAGGGGCUGGGCCUGCAGC -60
Get sequence
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