| MirGeneDB ID | Ami-Mir-205-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-205 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCUUCAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | American alligator (Alligator mississippiensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ami-mir-205b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ami-Mir-205-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-205-P2 Cli-Mir-205-P2 Cmi-Mir-205-P2 Cpi-Mir-205-P2 Gga-Mir-205-P2 Gja-Mir-205-P2 Pbv-Mir-205-P2 Pma-Mir-205-o2 Spt-Mir-205-P2 Sto-Mir-205-P2 Tgu-Mir-205-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCF_000281125.3_ASM28112v4_AMI_add) |
NW_017709854.1: 27055204-27055262 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AAGGUGACUGUGGUCCAUGGCUUUCUGGUGCCCUUCAUUCCACCGGAAUCUGUAGGGAUCAAAACCAGAUUUCAGUGAAAUGAAGCCCCUCAGACGUGGAAUUCAACCCCUGGCUUUUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AAGGUGACUGUGGUCCAUGGCUU--| UGCC C C UAGGGA UCUGG CUUCAUU CAC GGAAUCUG \ AGACU GAAGUAA GUG CUUUAGAC U UUUUUCGGUCCCCAACUUAAGGUGC^ CCCC A A CAAAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ami-Mir-205-P2_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0038230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCCUUCAUUCCACCGGAAUCUG -22
Get sequence
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| Star sequence | Ami-Mir-205-P2_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- GAUUUCAGUGAAAUGAAGCCCC -59
Get sequence
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